主角千仓静留们所居住的村庄，村民们忽然产生了异变，因此她为了寻找亲友的下落，与伙伴们搭上电车展开了冒险。
两年过去了，我们熟悉的世界已经结束，静留在她的家乡阿贺野过着平静无事的生活。但有一天，她发现了一个线索，将带领她踏上一段未知的旅程，寻找她失踪的朋友。
载着静留的电车从车站出发了。从车窗眺望景色、连接城镇和城镇的轨道都完全改变了的世界，以叶香所在的池袋为目标前进。于是，远处的神秘人物……?
静留一行人受到了东吾野村民的友好欢迎。但晶始终觉得慷慨的村民们似乎并不像表面上看起来那样友好……
随着火车继续前往池袋，每一个新的车站都开始变得越来越奇怪、疯狂。与此同时，晶似乎对其他人隐瞒了一些事情。
静留和玲实成功逃脱，并前往营救被控制着该地区的老大所囚禁的「医生」。在市民的帮助下，玲实带着她救下的医生赶往救治晶！
静留一行人决定将这趟列车命名为「远地点」号。随后静留因为一点小口角下了电车，波奇也跟了过去。然而第二天，抚子等人发现没法沿着铁路找到静留......
追赶静留的抚子、玲实和晶决定进入森林。尽管遇到了僵尸并陷入了困境，但她们发现了与僵尸女王黑木在一起的静留！抚子她们悄悄地跟随着，试图将静留救出。
听说大泉学园站变成了“练马之国的爱丽丝”的城镇“内利亚里兰”，玲实满怀期待。但是到达的城镇，不仅没有女主角爱丽丝的身影，还呈现出噩梦中的样子。
离池袋站还有10站。静留一行人从大泉学园站出发，途中他们发现了之前见过的仙人乘坐的天鹅船。在那里，仙人再次与他们相遇，并开始谈论这一路的旅程……
向着叶香所在的池袋开着阿波吉号的静留等人。但是，在终点站池袋站前的椎名町站，有阻止静留等人的刺客在等着！
经过漫长的道路，远地号终于到达了终点站池袋。追着闻到叶香气味的波奇，静留他们开始奔跑……！
由于蓬太郎的介入，叶香被带上了装甲列车。为了救回叶香，并顺便恢复世界的原状，静留等人乘坐远地号拼命追赶装甲列车。最终，静留再次与叶香面对面。
