当他们骤然醒来，拯救人类的行动也随之展开！为了避免人类灭绝，一群少男少女被选入「7SEEDS计划」，未知的命运却等在前方。
水夏和其他三人醒来后都感到一片茫然。四人来到一座小岛上，并试图找到活命的方法。
确信是牡丹绑架了他们，水夏和阿岚从营地溜走，并遇到了另一名幸存者。最终，牡丹透露了她所知道的事。
水夏的笨手笨脚让夏 B 组意外找到了剩下的成员。她的记忆帮他们确定了方位和下一步的行动。
阿岚、水夏和蝉丸在曾经的神户区偶然发现了秋组的定居地。他们看上去发展得不错，不过其领导是一群暴君。
在东京的废墟中，水夏、阿岚和蝉丸遇到冬组的唯一幸存者。春组到达荻野富士山后发现了水夏的讯息。
尽管藤子抱持怀疑，新卷还是加入了春组。听说新卷遇到过符合阿岚样貌的人物后，小花决定寻找阿岚。
小花和同伴发现了一座大型地下避难所。他们找到一名幸存者的日记，了解到曾在此避难的人们的悲惨下场。
春组和秋组的幸存者发现春组的居所已被毁弃。桃太郎在陌生人中间醒来。
小花等人与夏 A 组合力求生。在船上，小萤的表姐妹云雀告诉水夏，说小萤正走向生命的终点。
安居想起他在计划中所受的苦，以及甄选夏 A 组最终成员的残酷毕业测试。
小花开始确信如果留在村里就会被安居杀掉。水夏等人在秋组早前的居所附近登陆。
阿凉命令小花随他到地下寻找水源，致使她处境艰难。在洞穴里，安居回想起了小茂。
在阿春和其他人哀悼失踪的小花之际，夏 A 组赶走了安居和阿凉。新卷离开了定居地，他坚信小花依然活着。
安居和阿凉找到并观察夏 B 组，他们怀疑有陷阱，却意外发现这个小组不仅很随和，还欢迎他们的到来。
初来乍到的这两个人帮助夏 B 组。随着对小组的了解逐渐加深，阿凉对他们的生存能力起了疑心。安居开始把小夏认作小茂。
无忧无虑的小组在海边享受生活，但阿凉在测试他们的生存技能。小夏透露夏 B 组是放牛班组，这让安居非常生气。
当其他人都在寻找阿岚时，起了疑心的牡丹翻查了阿凉和安居的随身物品。另一名幸存者在别处了解荒野。
夏 B 组被困在浓密的海藻中。他们发现一艘大船并进行调查，而牡丹却心存警惕。被困住的阿岚看到了这艘船的风筝。
船身突然转动，组员们因此被拆散。阿岚前来相助，而牡丹的小组有了一个发现。
安居的幻觉导致他和阿岚陷入险境。蝉丸死里逃生，而小夏则鼓起勇气。
自然中的避难所变成了小型哺乳动物和人类的陷阱。与此同时，一种吃铁的细菌开始在整艘船上扩散。
藤子、小苣和小花三人重逢。在船上准备发射导弹之际，夏 B 组得知安居的过往和那场考试。
小花重新适应与他人相处。为了手动阻止导弹发射，夏 B 组齐心协力，但一连串的密码使整个过程变得复杂。
四处扩散的细菌开始进行攻击，而船上也仍然存在问题。导弹继续倒计时，小组仓皇逃向出口。
