疾风传指的是佐助投奔大蛇丸后三年发生的故事，故疾风传也可以理解为《火影忍者》第二部。 不知不觉《火影忍者》已经一路走了七年，鸣人从万年吊车尾的倒霉蛋慢慢地成长为能独当一面的忍者。从莽撞单纯的英雄主义男主角一步又一步地向忍道的达人迈进。为了友情，为了爱，为了被认可，为了自己的忍道，鸣人头也不回的奋斗了整整7年，以疾风的速度成长着。撒花庆贺的同时好消息自然不能少！2007早春火影动画也回归漫画突入第二章，冗长乏味的TV动画，终于顺应民意走回“正途”。
“这个世界怎么样都无所谓了。”说出这番话的带土，令鸣人感到极为愤怒。两人各自的心意在战场产生激烈的冲突。卡卡西为阻止带土而说出自己的想法，但他的言语无法传达到带土的心中，带土开始对卡卡西施展致命一击。正当卡卡西想着“已经不行了”的那一瞬间，鸣人阻止了带土的攻击。之后，鸣人喊出了卡卡西曾经对他说过的话语：“我绝不会让我的同伴被杀！！！”
十尾终于打破结界而现身了。身形巨大又恐怖的十尾拥有着无法估量的力量，以惊天动地的气势向着鸣人他们袭来。虽然众人以九尾九喇嘛为首发动了攻击，但十尾的力量太过强大，无论何种攻击都无法对它造成伤害，最终用尽查克拉的九喇嘛和八尾牛鬼的身形也消失了。面对陷入性命攸关危机的鸣人他们，十尾放出了必杀的尾兽玉。鸣人他们已经没有能够避开尾兽玉的术了，但——。
鸣人等人成功阻止了十尾的行动，并与忍者联合军的人们一同向带土和斑发动攻击。然而，十尾却突然间变化了形态，并开始施放尾兽玉，其威力强大到尾兽们根本无法与之相提并论。强力的尾兽玉即使在遥远之处爆炸也依然能够看得到，接连放出的尾兽玉使远处的街市中弹，在一瞬间就让街市消失了。但为什么十尾总是瞄准远处攻击呢？就在谁也不知道这其中理由的时候，尾兽玉正朝着忍者联合军的本部飞去……
众多的同伴们都受伤倒地，甚至丧命。这其中也包括一直陪伴自己战斗至今的宁次，鸣人因此沉浸在悲痛当中，但由于雏田的鼓励，鸣人重新取回了斗志。同样在此战中丧生的鹿久，最后传达过来的战术是让全部忍者接受九尾查克拉，使所有人的力量倍增。忍者们的意志因此与鸣人同步，大家万众一心，为了不让宁次白白死去，也为了不让众人之间的羁绊被斩断，所有的忍者如同起舞一般向十尾发动了突击！！
即使舍弃生命也要守护村子的鼬的心意究竟是什么？以及，一族是什么？村子是什么，忍者是什么？佐助为了知道这一切而返回木叶忍者村，在他的面前，四位火影由于秽土转生而复活了！初代火影·柱间。第二代火影·扉间。第三代火影·日斩。以及，第四代火影·水门。佐助向日斩质问关于鼬的全部，又向扉间质问宇智波一族的秘密。而关于村子和忍者的事情，终于由柱间一一道出。故事回溯到战乱时代——村子还不存在的那个时代……
那是柱间还是孩子的时候。在名为“村子”的系统并不存在、一族之间互相争斗的时代中，柱间与斑相遇了。柱间认为这个让孩子们死去的忍者世界是错误的，并梦想着能改变世界，但没能得到墨守成规的大人们的理解。在残酷的时代相遇的柱间与斑，互相隐藏了自己的真实身份，谈论着关于未来的话题，两人开始拥有了同样的想法。之后，同样梦想着改变忍者世界的两人，决定建立一个不会让孩子死去的集落……
得知斑是宇智波一族的少年后，柱间的父亲给柱间下达了“去杀了斑”这样冷酷的命令。于是同样期盼着未来的两人变成互相战斗的对手，柱间心中描绘的未来也在中途就崩溃了。时光飞逝，每天不停持续着战斗的两人，也分别成为了一族之长。就在千手一族和宇智波一族之间的战斗白热化之际，尚未放弃梦想的柱间提出与斑携手共进，但斑对此充耳不闻，并发动了须佐能乎……
在漫长激斗的最后，千手一族与宇智波一族终于握手言和，为了让梦想成为现实，他们开始建造村子。柱间和斑站在他们小时候曾一同交谈的、能望见森林的山崖上，眺望着正在逐渐发展的街市。在那里，两人再次交谈，他们的身影简直就和幼时一同谈论梦想的自己别无二致。柱间决定让斑当火影，但遭到弟弟扉间的反对，扉间警告他宇智波很危险。最终柱间成为了初代火影，并希望斑能协助自己，成为自己的左右手，但……
为了守护村子，柱间打倒了身为朋友的斑，两人之间的战斗迎来了终结。之后，希望知道何为村子、何为忍者而发问的佐助，被柱间告知忍者即为“忍耐之人”。佐助得知了如此作答的柱间的意志，于是一边说着“鼬也是继承了这样的意志。继承了这意志的是宇智波一族的人，还真是讽刺啊”，一边露出了冷笑。聆听了所有火影的发言，并了解了忍者以及村子的成立的佐助，他从其中推导出的答案究竟是！？
由鸣人打头阵的忍者联合军在战场与带土和斑持续着激烈的战斗。忍者们得到鸣人的查克拉外衣守护，承受着斑和十尾的猛烈攻击。但，在十尾的多次连续攻击下，鸣人的体力开始见底，包覆着忍者们的查克拉外衣也消失了。另一方面，卡卡西与带土在神威的异空间内对峙。卡卡西在即将发动致命一击时却犹豫不决，而带土则开始对卡卡西诉说关于琳的死亡。琳死亡的真相即将浮出水面……
十尾变形到距离最终变化仅剩一步之遥的程度，为了释放特大的尾兽玉而开始蓄力。忍者们已经没有能够阻止尾兽玉的士气和战力了，但小樱和鹿丸等人仍不打算放弃。在鹿丸的策略之下，忍者们打算集合力量阻止尾兽玉，但尾兽玉的威力实在太过巨大，根本没可能将其阻止。已经结束了——正当所有的忍者如此想着并将要放弃之时，因秽土转生而复活的水门现身了，并将众人从绝境当中拯救出来。鸣人终于再次与父亲相会了，而就在此时，另一个人——那名忍者也现身了……
