为了捍卫图书馆的自由，战争，一触即发！ 西元2019年，“阅读”已不再是人类的自由权利。日本政府成立“媒体良化组织”，强立法令对书籍实施管制、销毁，仿佛现代文字狱。而为了保障人类阅读自由，“图书馆”挺身而出，更编制了武装组织“图书队”抵御良化组织的攻击，冲突日渐激烈。 图书队新入队员笠原郁（荣仓奈奈 饰）高中时曾被一名图书队军官拯救，因憧憬而立志加入图书队找出她的王子大人，但她的王子却被魔鬼教官堂上笃（冈田准一 饰）怒斥为“最失职的图书队员”，因此两人超级不合。但在朝夕相处后，郁渐渐对堂上改观，更发现了堂上其实与她憧憬的对象有所关联…。 此时，收藏着媒体良化组织许多不利资料的小田原资讯历史博物馆，宣布将把资料捐赠给关东图书馆，预料媒体良化组织会不择一切手段抢夺，特殊部队决定进行武装行动，堂上却突然将郁调离前线，改担任基地司令护卫，此举却造成郁的强烈不满。到了资料移转当日，前线爆发激烈战斗，激战之间堂上却收到消息：司令与郁被绑架，下落不明！史上最大的图书馆战争，一触即发！
