У світі Наруто непомітно промайнули два роки. Колишні новачки поповнили ряди досвідчених шинобі в ранзі тюнінів і джонінів. Головні герої не сиділи склавши руки - кожен став учнем одного з легендарних санінів - трьох великих ніндзя Конохи. Хлопець у помаранчевому продовжив навчання у мудрого, але ексцентричного Джирайі, поступово сходячи на новий щабель бойової майстерності. Сакура висунулася в помічниці та довіреної особи цілительки Тсунаде - нового вождя Селища Листя. Ну а Саске, чия гординя призвела до вигнання з Конохи, приєднався до тимчасового союзу зі зловісним Орочімару, причому кожен вважає, що лише використовує іншого до певного часу. Короткий перепочинок закінчився, і події в черговий раз розгортаються з ураганною швидкістю. У Коносі знову проростає насіння старих чвар, посіяні першими хокаге. Таємничий лідер Акацукі привів у дію план набуття світового панування. Неспокійно у Селі Піску і сусідніх країнах, скрізь спливають старі таємниці, і стає зрозумілим, що таки доведеться за все розплачуватися. Довгоочікуване продовження манги вдихнуло нове життя в серіал і нову надію в серця незліченних фанатів!
Какаші відчайдушно намагається достукатися до Обіто, але його слова падають на глухі вуха. Натомість Обіто звинувачує Какаші в тому, що він сміття, що розлючує Наруто, змушуючи його втрутитися і захистити свого сенсея.
Бар'єр зруйновано і з'являється Десяти Хвостий! З незбагненною силою у своїй атаці він посилає ударні хвилі в повітря! Курама бере на себе ініціативу і намагається перейти в наступ, але безсилий проти величезної сили Десятихвостого.
Об'єднані сили шинобі починають наступ на Обіто та Мадару. Але Десятихвостий раптово трансформується і кидає потужні бомби у бік віддалених міст.
Наруто переповнений горем через смерть Неджі, але слова Хінати відновлюють його бойовий дух.
Саске повертається до поселення Прихованого Листа в пошуках відповідей, перед ним стоять Перший Хокаге Хаширама, Другий Хокаге Тобірама, Третій Хокаге Хірузен і Четвертий Хокаге Мінато - всі реанімовані.
Коли Хашірама був дитиною, поселень ще не існувало. Саме в цей сповнений міжусобиць час він зустрів Учіху Мадару.
Мадара і Хашірама з часом стають лідерами своїх кланів.
Клани Сенджу та Учіха об'єднуються, щоб побудувати поселення шинобі та здійснити свої мрії.
Вислухавши розповіді Хашірами та інших колишніх Хокаґе, Саске нарешті розуміє, як з'явилося поселення Листя та його шинобі.
Боротьба точиться між Наруто, який стоїть в авангарді союзних сил шинобі, і командою Мадари та Обіто.
Десятихвостий стоїть на порозі свого остаточного перетворення і починає формувати масивну Бомбу Хвостатого Звіра.
