วูล์ฟเวอรีน และเหล่า เอ็กซ์-เม็น ซีซั่น 1 ล้น

เกิดเหตุระเบิดลึกลับครั้งใหญ่ทำลายเอ็กซ์แมนชัน ศาสตราจารย์เอ็กซ์และจีน เกรย์หายตัวไป และอาจไม่ได้กลับมาอีกเลย

บีสต์กับวูล์ฟเวอรีนพยายามรวมตัวเอ็กซ์เมนที่จากไปอีกครั้ง แต่ไม่ใช่ทุกคนที่อยากกลับมา

ด้วยความช่วยเหลือของแองเจิล เอ็กซ์เมนจึงย้ายกลับไปที่แมนชันได้ ฟอร์จเข้าร่วมทีมเพื่อซ่อมเซเรโบรและแบล็กเบิร์ด

เอ็มอาร์ดีไล่ล่าแม็กม่า จนเธอกลายเป็นมนุษย์เพลิงที่หยุดรถทุกคันรอบตัว วูล์ฟเวอรีนต้องช่วยแม็กม่าจากเอ็มอาร์ดี

มีข่าวว่าพบไนท์ครอว์เลอร์บนเรือ ระหว่างเดินทางไปเจโนชากับมนุษย์กลายพันธุ์คนอื่นๆ เหล่าเอ็กซ์เมนจึงออกตามหาตัวเขา

ฮัลค์ออกอาละวาดทำลายเขตรกร้างในแคนาดา นิค ฟิวรี่แบล็กเมลวูล์ฟเวอรีนให้จัดการปีศาจร้าย

ศาสตราจารย์เซเวียร์เตือนเอ็กซ์เมนถึงเหตุการณ์ที่จะกวาดล้างประชากรมนุษย์กลายพันธุ์ไปครึ่งหนึ่ง ไนโตรจะทำลายตัวเองในเจโนชา

ในอนาคต พวกเซนติเนลจับตัวศาสตราจารย์เอ็กซ์ไป ศาสตราจารย์วางแผนหลบหนีร่วมกับโดมิโนและบิชอป

เรือที่ไนท์ครอว์เลอร์ใช้ มาถึงเจโนชา สการ์เล็ท วิทช์พาไนท์ครอว์เลอร์เดินชมรอบๆ เพื่อให้เห็นความมหัศจรรย์ที่แม็กนีโต้สร้างไว้

วูล์ฟเวอรีนเดินทางไปสู่อดีตที่จำได้ ในฐานะเอเจนต์ของเวพอนเอ็กซ์ และพบกับลูกสาวของมาเวอร์ริค

ไซคลอปส์ ซึ่งยังคงโศกเศร้ากับการสูญเสียจีน เกรย์ เชื่อว่ามิสเตอร์ซินนิสเตอร์เป็นคนจับเธอไป เขาต่อสู้กับพวกมอเราเดอร์ โดยมีเอ็กซ์เมนคอยช่วย

แม็กนีโต้ส่งกลุ่มอะโคไลต์มาปล่อยมนุษย์กลายพันธุ์ออกจากคุก ในขณะที่เหล่าเอ็กซ์เมนต้องต่อสู้กับกลุ่มบราเธอร์ฮูด

มิสทีกเตือนวูล์ฟเวอรีนว่าลูกสาวมาเวอร์ริคกำลังตกอยู่ในอันตราย ทั้งคู่แทรกซึมเข้าไปในเวพอนเอ็กซ์ และต้องต่อสู้กับมาเวอร์ริคกับเซเบอร์ทูธ

โมโจพาตัวไนท์ครอว์เลอร์กับสการ์เล็ท วิทช์ไปออกรายการโทรทัศน์ และบังคับให้วูล์ฟเวอรีนจู่โจมทั้งคู่ สไปรัลและกลุ่มรีฟเวอร์ปรากฏตัวขึ้นเช่นกัน

ในอนาคต ศาสตราจารย์เซเวียร์กับเอ็กซ์เมนทีมใหม่ต่อสู้กับพวกเซนติเนล จนได้พบกับโพลาริส ซึ่งใช้ชีวิตอยู่ตามลำพังและบอบช้ำที่เจโนชาถูกทำลาย

วูล์ฟเวอรีนกลับมาพบซิลเวอร์ซามูไรที่แมนชัน ซามูไรบังคับให้วูล์ฟเวอรีนต่อสู้กับเขาจนถึงชีวิต เพื่อทวงศักดิ์ศรีกลับคืนมา

เอ็มอาร์ดีเริ่มตามล่ามนุษย์กลายพันธุ์ เพื่อบีบให้เอ็กซ์เมนตอบโต้ แองเจิลเข้าร่วมกับเอ็กซ์เมน และพยายามทำลายมาสเตอร์โมลด์

ปีกของแองเจิลเสียหายอย่างรุนแรง ด้วยน้ำมือของเอ็มอาร์ดี มิสเตอร์ซินนิสเตอร์เสนอให้เปลี่ยนแองเจิลเป็นอาร์คแองเจิล

ไซคลอปส์เสียสมาธิระหว่างต่อสู้กับจั๊กเกอร์น็อต เพราะเห็นภาพจีน เอ็มม่าเสนอตัวลบความทรงจำทั้งหมดเกี่ยวกับจีนออกจากความคิดของสก็อตต์

ไซคลอปส์กับวูล์ฟเวอรีนรายงานการค้นพบของเอ็มม่าให้ศาสตราจารย์เอ็กซ์ทราบ

แกมบิทมาถึงเจโนชา เพื่อขโมยหมวกของแม็กนีโต้ และใช้เสน่ห์ให้โพลาริสคอยช่วย วูล์ฟเวอรีนกับไนท์ครอว์เลอร์มุ่งหน้าไปหยุดเขาที่เจโนชา

จีนใช้พลังทำให้เอ็มม่าหาตัวเธอเจอ เอ็มม่ากับสก็อตต์พยายามพาตัวจีนกลับมา แต่อาร์คแองเจิลเข้ามาขัดขวาง และพาพวกเขาไปหามิสเตอร์ซินนิสเตอร์

วูล์ฟเวอรีนจับเอ็มม่าไปขัง ก่อนไซคลอปส์เข้ามาช่วย เฮลไฟร์คลับรู้ว่าจีนถูกพลังฟีนิกซ์ครอบงำ

เอ็มม่าสืบรู้แรงจูงใจที่แท้จริงของเฮลไฟร์คลับ และต่อสู้เคียงข้างไซคลอปส์เพื่อปลดปล่อยจีน ในขณะที่พวกเซนติเนลบุกทำลายเกาะเจโนชา

เอ็กซ์เมน เอ็มอาร์ดี และหน่วยชีลด์ต่อสู้กับพวกเซนติเนล ดิอินเนอร์เซอร์เคิลเปิดโปงว่าเอ็มม่าและสาวๆ สเตปฟอร์ดคุ๊กคูเป็นคนทำลายแมนชัน