เรือดำน้ำของกองกำลังป้องกันตนเองทางทะเลญี่ปุ่นเกิดชนเข้ากับเรือดำน้ำนิวเคลียร์ของสหรัฐ สังหารลูกเรือกว่า76ชีวิต รวมถึงกัปตันเรือ ไคเอดะ ชิโระ แท้จริงแล้วอุบัติเหตุเป็นเพียงหน้าฉากเพื่อนำลูกเรือของเรือดำน้ำกองกำลังป้องกันตนเองขึ้นเรือซีแบท เรือดำน้ำนิวเคลียร์ลับสุดยอดที่สร้างจากความร่วมมือของญี่ปุ่นและสหรัฐ เรื่องซับซ้อนขึ้นเมื่อไคเอดะได้บรรจุหัวรบนิวเคลียร์ในซีแบท จากนั้นจึงทำการกบฏและหลบหนี
เรือดำน้ำของกองกำลังป้องกันตนเองทางทะเลญี่ปุ่น ยามานามิ ชนเข้ากับเกิดชนเข้ากับเรือดำน้ำนิวเคลียร์ของสหรัฐอเมริกา สังหารลูกเรือกว่า76ชีวิต รวมถึงกัปตันเรือ ไคเอดะ ชิโระ กัปตันเรือดำน้ำดีเซลประจำกองกำลังป้องกันตนเองทางทะเลญี่ปุ่น ทัตสึนามิ อย่างฟุคามาจิ ฮิโรชิ เกิดกังขาในอุบัติเหตุครั้งนี้ และสั่งให้วิเคราะห์ข้อมูลจากบันทึกอุบัติเหตุอีกครั้ง
ซีแบท เรือดำน้ำนิวเคลียร์รุ่นล่าสุดที่ถูกชิงไปด้วยฝีมือของไคเอดะ ลอยลำขึ้นต่อหน้ากองเรือที่เจ็ดของสหรัฐอเมริกา ที่รวบรวมกำลังพลเพื่อจมซีแบทในฐานะภัยก่อการร้าย ไคเอดะได้ประกาศบางสิ่งที่ชวนช็อคออกมา
เรือพลังงานดีเซลทัตสึนามิของฟุคามาจิมาถึงพื้นที่ ขณะที่ยุทธการยังคงหยุดนิ่งหลังจากคำประกาศของไคเอดะ เพื่อที่จะหยุดยั้งไคเอดะไว้ ฟุคามาจิจึงได้ขึ้นเรือซีแบทไป
ไคเอดะเริ่มเปิดฉากตอบโต้กองทัพสหรัฐอเมริกา เรือดำน้ำนิวเคลียร์ของกองเรือที่เจ็ดสามลำเข้าใกล้ซีแบททุกขณะ เลขาธิการนายกรัฐมนตรี อุนาบาระ วาตารุ มุ่งหน้าไปยังการประชุมนานาชาติกับประธานาธิบดีเบนเน็ตต์แห่งสหรัฐ
การประชุมนานาชาติระหว่างญี่ปุ่นและสหรัฐอเมริกาเปิดฉากขึ้น แต่กลับไม่มีฝ่ายใดยอมลดราวาศอก อีกด้านหนึ่ง กองเรือที่สามของสหรัฐอเมริกาได้เปิดฉากยิงตอร์ปิโดต่อต้านเรือดำน้ำใส่กองเรือของกองกำลังป้องกันตนเองซึ่งนำโดยนายพลนุมาตะ ซึ่งได้รับคำสั่งให้ทำการคุ้มกันซีแบท
หลังผ่านศึกกับกองเรือที่สามแห่งสหรัฐอเมริกา ไคเอดะก็ได้มาถึงอ่าวโตเกียวเพื่อตกลงเป็นพันธมิตรกับญี่ปุ่น รัฐบาลญี่ปุ่นได้แถลงประกาศข้อมูลเกี่ยวกับเหตุการณ์ซึ่งเริ่มต้นจากโปรเจ็คท์ลับสุดยอดอย่างซีแบท
