Subaru Natsuki to zwyczajny licealista, który pewnego dnia wychodząc ze sklepu, przenosi się do innego świata. Kiedy zaś zostaje napadnięty przez bandę opryszków, z opresji ratuje go piękna, srebrnowłosa dziewczyna. Chłopak postanawia zostać z nieznajomą, by w jakiś sposób jej się odwdzięczyć, jednak nie jest on wtedy jeszcze świadom strasznego przeznaczenia, jakie na niej ciąży. Gdy dwójka ta zostaje wkrótce zaatakowana przez wrogów, obojgu nie udaje się przeżyć tego starcia. W tej właśnie chwili Subaru dowiaduje się, iż posiada moc „przewinięcia śmierci”, cofnięcia się w czasie do momentu, kiedy pierwszy raz postawił stopę w tym dziwnym świecie. Jest jednak jedno ale – tylko on pamięta, co się wydarzyło.
Wracający z rzekomo zwycięskiej bitwy z Białym Wielorybem oraz Kultem Wiedźmy Subaru postanawia przyznać się Emilii, że błękitnowłosa pokojówka wyznała mu miłość. Jednak niekończący się horror powraca! Po raz kolejny Rem zostaje zapomniana. Gdzie chłopak popełnił błąd? Czy da się jeszcze zacząć wszystko od zera?
Mimo początkowych trudności obozy Emilii oraz Crusch utrzymują sojusz i postanawiają razem walczyć z Kultem Wiedźmy. Jednakże czy podołają potężnych Arcybiskupom Łakomstwa oraz Chciwości? Postanawiają udać się do Sanktuarium, gdzie Ram pojechała z mieszkańcami wioski, a także przedyskutować wszystko z Roswaalem...
W poszukiwaniu Roswaala oraz mieszkańców wioski Subaru, Emilia oraz Otto udają się do Lasu Zagubionych, w którym mają natrafić na ukrytą za barierą tajemniczą kryjówkę, Sanktuarium. Jednak w drodze dochodzi do incydentu, w wyniku którego chłopak trafia do dziwnego grobowca. A tam czeka na niego upiorna kobieta, Echidna...
Subaru zostaje wypuszczony z twierdzy Wiedźmy Chciwości i razem z Ottem, Emilią oraz krnąbrnym Garfielem dostaje się do osady półludzi w centrum Sanktuarium. Jednak okazuje się, że zostali złapani w pułapkę – by się stamtąd wydostać i przy okazji uwolnić mieszkańców wioski, kandydująca na króla Lugniki elfka półkrwi musi przejść Próbę...
W czasie Próby Subaru mierzy się ze swoją przeszłością, by następnie w tym tajemniczym śnie spotkać samą Wiedźmę Chciwości, Echidnę! Czym jest test wymagany do zdjęcia bariery otaczającej Sanktuarium? I jak poradzi sobie z nim Emilia? Tymczasem w rezydencji Roswaala...
Subaru przechodzi pierwszą Próbę, jednak rezygnuje z dalszych zmagań, by umożliwić Emilii zdobycie niezbędnych władczyni pewności siebie oraz zaufania ludu. Udaje mu się również wynegocjować wypuszczenie z Sanktuarium mieszkańców Arlam. Jednak gdy wraca do rezydencji, czuje dziwny niepokój. Ona wróciła...
Choć po powrocie przez śmierć Subaru udaje się zdążyć do rezydencji Roswaala przed atakiem Elsy Granhiert, nic w ten sposób nie osiąga, gdyż Łowczyni Trzewi ponownie uderza wsparta demonicznymi bestiami! I gdy ostatkiem sił chłopak próbuje dostać się do pokoju Rem, zostaje przeniesiony do Zakazanej Biblioteki, gdzie Beatrice okazuje się być właścicielką pewnej księgi... Jakie sekrety jeszcze skrywa ród wspierający Emilię w drodze do tronu?
Subaru, który poprzez powroty przez śmierć próbuje zapobiec masakrze w rezydencji, niespodziewanie zostaje zaatakowany i uwięziony przez Garfiela oraz Ryuuzu! Problem goni problem, spisek spiskiem pogania, a rozwiązania ani widu, ani słychu! W tej trudnej chwili z pomocą przychodzi mu jego skryty przyjaciel...
Subaru po raz kolejny przeżywa piekło, tym razem w Sanktuarium. By cofnąć masakrę, do jakiej doprowadził Garfiel w swojej zwierzęcej formie, musi ponownie wrócić przez śmierć. Gdy przenosi się poza barierę, tajemniczy kamień ponownie teleportuje go w miejsce, do którego trafił po pierwszym przybyciu do Lasu Zagubionych. Czy Wiedźma Chciwości pomoże mu znaleźć właściwą drogę?
Subaru, podczas herbatki u Echidny, ma okazję porozmawiać z Wiedźmą Łakomstwa i wyciąga z niej informacje, jak pokonać jednego z jej pieszczochów, Wielkiego Królika. I gdy myśli już, że wszystko w tej linii czasowej jakoś się ułoży, po powrocie do grobowca nie spotyka Emilki – zamiast tego Sanktuarium zostaje spowite tajemniczą ciemnością. Wiedźma Zazdrości przybywa...
Po piekielnie trudnych przeżyciach przed ostatnim powrotem przez śmierć, w aktualnym przebiegu Subaru radzi sobie doskonale: zmotywował Emilię, poznał sekret Ryuuzu, a także zdołał postawić się Garfielowi i uniknąć śmierci z jego zwierzęcych rąk. Teraz zmierza do rezydencji, wiedząc, że Beatrice nie stoi po stronie Kultu Wiedźmy. Czy zdoła uratować małą bibliotekarkę, Rem, Frederikę oraz Petrę przed nadchodzącym atakiem Elsy i władczyni bestii?
Choć Subaru ponosi jeszcze większą klęskę niż w poprzednim zapętleniu, m.in. ściągając śmierć na wioskę Arlam, dowiaduje się wielu szokujących rzeczy, bez których trudno byłoby rozwiązać niesamowicie skomplikowaną sytuację w Sanktuarium oraz rezydencji. Z mocnym postanowieniem, że będzie wracał tyle razy, ile tylko to koniczne, rusza w dalszą podróż przez śmierć...
Gdy Echidna pokazuje swoją prawdziwą, wykraczającą poza ludzkie pojęcie twarz wiedźmy, Subaru postanawia, że nie z nią zawrze kontrakt, a z okrutnie potraktowaną Beatrice. Jednak w tej samej chwili do świata, gdzie chłopak jest zapraszany na herbatkę, wkracza prawdziwe zło - Wiedźma Zazdrości, Satella...
Subaru, po otrzeźwieńczym ciosie Ottona, opowiada przyjacielowi całą prawdę. Zdradza kupcowi, iż Sanktuarium wkrótce zaatakują Wielkie Króliki i ktoś musi przejść Próbę, by mogli przed nimi uciec, a i to niczego nie gwarantuje, gdyż w rezydencji już czekają na nich płatni mordercy wynajęci przez samego Roswaala. Otto po raz pierwszy wchodzi w interes, który ma marne szanse na sukces. Następnie podróżujący przez śmierć chłopak udaje się do pana ziemskiego, by zaproponować mu zakład, którego stawką będą ich pragnienia...
Subaru łączy siły z przyjacielem, z którym opracowuje plan wyswobodzenia tak Sanktuarium, jak i rezydencji bez wykorzystania powrotu przez śmierć. Gdy udaje im się przekonać Roswaala do zawarcia zakładu, kolejnym celem jest namówienie do współpracy Garfiela, a także umożliwienie Emilii przejścia Próby. Jednak wtedy kandydatka do tronu gdzieś znika. Po długich poszukiwaniach Subaru znajduje ją w Grobowcu... Jak potoczy się ich rozmowa?
Choć Subaru w końcu udaje się przekonać Emilię, że ją kocha, i razem z dziewczyną opuszcza Grobowiec, na zewnątrz już na nich czeka Garfiel... Młodszy brat Frederiki przemienia się w bestię i rzuca się na przybysza z innego świata... Co się stało z Ram oraz Ottem? Czy jest jeszcze jakaś nadzieja, by wygrać zakład z Roswaalem?
Dzięki pomocy przyjaciół Garfiel ponownie podchodzi do Próby i wchodzi do Grobowca, gdzie rozprawia się ze swoją przeszłością. Następnie chłopak dołącza do grupy chcącej uwolnić Sanktuarium. Kolejna do Próby podchodzi Emilia, zachęcona głupkowatym, ale płynącym prosto z serca zachowaniem Subaru. Trafia do miejsca znanego jej z dzieciństwa, Puszczy Elior, gdzie przyjdzie jej stawić czoła wspomnieniom...
Emilia po raz kolejny podchodzi do Próby, jednak tym razem z silną determinacją oraz wsparciem Subaru radzi sobie całkiem nieźle. Jednak po rozgrzewce nadchodzi prawdziwe piekło. W Wielkim Lesie Elior zjawia się nieoczekiwany i niechciany gość, odpowiedzialny za Chciwość członek Kultu Wiedźmy, Arcybiskup Regulus Corneas. Czy Fortuna i Petelgeuse zdołają ocalić małą księżniczkę?
Podczas gdy Emilia mierzy się ze swoją szkarłatną przeszłością, przed Grobowcem Subaru i spółka rozmawiają z Cimą oraz Ryuuzu. Babcia opowiada dzieciakom, co zobaczyła, gdy ruszyła na ratunek Garfielowi. Ujawniona zostaje geneza Sanktuarium! Czego tak naprawdę szukała w tej osadzie Echidna i jaki udział w stworzeniu Sanktuarium miały Beatrice oraz jej przyjaciółka, Ryuuzu Meyer?
Emilia przechodzi pierwszą Próbę, a dwie kolejne według Echidny mają być dla niej błahostką. Droga do uwolnienia Sanktuarium stoi otworem! Jednak dziewczyna po wyjściu z Grobowca nie zastaje ukochanego, który w tym samym czasie razem z Garfielem i Ottonem rozprawia się z hrabią Mathersem. Pora ruszać obronić rezydencję! Czy dzielnemu podróżnikowi przez śmierć uda się rozwikłać plątaninę zależności i doprowadzić do szczęśliwego zakończenia?
Po uporaniu się z pierwszą Próbą Emilia wychodzi z Grobowca, gdzie spotyka Ram... niestety w oddali widzi zbliżającego się do nich Roswaala! W tym samym czasie Subaru, Otto oraz Garfiel gnają, ile sił, by ocalić rezydencję przed atakiem wynajętych zabójczyń! Czy uda się im uratować Petrę, Rem, Fredericę oraz Beatrice? I co z nadchodzącym atakiem Wielkiego Królika?
Subaru oraz Otto, wsparci potężnym sojusznikiem, docierają do rezydencji, gdzie już grasuje jedna z najemniczek, Łowczyni Trzewi. Na miejscu Garfiel rzuca się na ratunek starszej siostrze i rozpoczyna się zaciekła walka. Jednak do rezydencji już zbliża się kolejne zagrożenie... Czy podróżnikowi przez śmierć i jego kompanom uda się odmienić bieg historii?
Emilia przechodzi drugą Próbę i umotywowana wsparciem mieszkańców Sanktuarium oraz Arlam wkracza do Grobowca, być może po raz ostatni, by podejść do trzeciego testu, w którym ma się zmierzyć z katastrofą, która dopiero ma nadejść. W tym samym czasie, w rezydencji rodu Mathers, niosący na plechach Rem Subaru zmierza do biura Roswaala, z którego zamierza uciec sekretnym przejściem. Po drodze zatrzymuje go jednak czarny król lasu, Guiltylowe...
Choć w rezydencji częściowo udaje się zażegnać niebezpieczeństwo, Subaru wciąż musi wyciągnąć z płonącego budynku Beatrice. W tym samym czasie na Emilię, która przeszła trzecią Próbę i zdjęła barierę, po wyjściu z Grobowca zamiast mieszkańców Arlam oraz Sanktuarium czeka śnieżyca! Czy aktualny przebieg uda się jeszcze uratować bez sięgania po powrót przez śmierć?
Podczas gdy w Sanktuarium po raz kolejny zaczyna szaleć śnieżyca i zbliża się jedna z demonicznych bestii, Wielki Królik, zdesperowany Subaru rzutem na taśmę przekonuje Beatkę i razem ruszają Emilii na ratunek. Czy chłopak zdoła w końcu wyrwać się z tej zapętlonej teraźniejszości i zrobić krok ku przyszłości, w której jego pani i ukochana zarazem zostaje królową Lugniki?