Magia to nie wymysł bajek i legend – to swoisty rodzaj technologii kształtującej rzeczywistość i nikt tak naprawdę nie wie kiedy się pojawiła i skąd się wzięła. Moce nadprzyrodzone stały się technologią usystematyzowaną przez magię, która uważana jest za zwyczajną, techniczną umiejętność. “Użytkownik Mocy Nadprzyrodzonych” zwany teraz jest “Magicznym Technikiem” (w skrócie, Magikiem). Ludzie ci są szkoleni w specjalnych liceach i uniwersytetach magicznych. Historia ta opowiada o: Tatsuyi, “wadliwym” starszym bracie bez przesadnych życiowych aspiracji. Miyuki, perfekcyjnej młodszej siostry będącej prawdziwym człowiekiem sukcesu. Po tym jak oboje rozpoczynają Magiczne Liceum, rozpoczyna się ich codzienne życie pełne niespodziewanych problemów.
Gdy zbliżał się kwiecień 2096 roku i Tatsuya awansował na drugi rok, wokół niego zaszło wiele zmian. Tatsuya i Mizuki przenieśli się do nowo utworzonego Departamentu Inżynierii Magicznej. Mikahiko przeniósł się z drugiego wydziału do pierwszego. Tatsuya i Miyuki wprowadzili się do Mizunami, służącej z rodziny Yotsuba, i cała trójka zaczęła mieszkać razem. Tatsuya przybywa do szkoły z nadzieją na spokojne życie studenckie w tym roku, ale nowi uczniowie różnią się od siebie, w tym bliźniaczki z rodziny Shichiso, Kasumi i Izumi, oraz nowy valedictorian, Shippo Takuma, który ma poczucie rywalizacji z rodziną Shichiso. ......
Ceremonia wstępna dobiegła końca, a kluby ponownie rozpoczęły rekrutację nowych uczniów w tym roku. Klub Robo i Klub Motocyklowy rozpoczynają spór o nowych uczniów, a Kasumi, członek Komitetu Moralności Publicznej, i Shippo, członek Komitetu Wykonawczego Federacji Działalności Klubowej, interweniują. Jednak zaczynają się kłócić o to, kto powinien przejąć inicjatywę, a sytuacja w końcu staje na głowie. W międzyczasie Koichi, głowa rodziny Nanakusa, planuje wykorzystać początki manipulacji medialnej humanistów USNA, aby zmniejszyć siłę rodziny Yotsuba.
Otrzymaliśmy informację, że anty-magiczny senator Kanda planuje odwiedzić Pierwsze Liceum wraz z mediami. Jeśli znajdzie się tam cokolwiek związanego z wojskiem, zamierza zrobić z tego wielkie zamieszanie w prasie i twierdzić, że magiczne liceum zamieniło się w miejsce edukacji wojskowej. Dlatego Tatsuya zaproponował, aby uczniowie eksperymentowali z rezydentnym, kontrolowanym przez grawitację magicznym reaktorem termojądrowym (reaktorem gwiezdnym). Próbuje argumentować, że magiczna edukacja w liceum Daiichi przyczynia się do pokoju międzyludzkiego, rozwiązując problem energii za pomocą magii.
Eksperyment z piecem gwiezdnym okazał się wielkim sukcesem, o którym szeroko informowano w wiadomościach. Jednak Shippo, któremu ojciec powiedział, że sprawą senatora Kandy zajmie się rodzina Shichikusa, uważa, że rodzina Shichikusa wykorzystała Tatsuyę dla własnej korzyści i wyładowuje swoją urazę na Kasumi, gdy ta przechodzi obok. Kacumi również nie może przeoczyć zniewagi wobec własnego domu i oboje przygotowują się do walki za pomocą magii, ale zostają odkryci przez członka Komitetu Dyscypliny Publicznej i zatrzymani. Aby wyeliminować urazę między nimi, Tatsuya proponuje mecz, który wyłoni zwycięzcę.
Magiczne szkoły średnie w całym kraju zostały powiadomione, że niektóre z wydarzeń Dziewięciu Igrzysk Szkolnych zostaną zmienione. Zmieniono trzy z sześciu zawodów, co oznacza, że aż połowa konkurencji zostanie zmieniona. Aby poradzić sobie z nagłą zmianą wydarzeń, samorząd uczniowski I Liceum Ogólnokształcącego został zmuszony do zrozumienia zasad, ponownego wyboru sportowców i ponownego dostosowania CAD. Podczas gdy wszyscy narzekają na nagły czas wprowadzenia zmian, na miesiąc przed rozpoczęciem zawodów dziewięciu szkół, Tatsuya podejrzewa, że wszystkie nowo dodane konkurencje mają silny wojskowy posmak.
Aby poradzić sobie z nagłą zmianą konkurencji w Turnieju Dziewięciu Szkół, Tatsuya, wraz z innymi członkami rady uczniowskiej, był bardzo zajęty. Pewnego dnia Tatsuya otrzymał wiadomość e-mail od nieznanego nadawcy. Wynikało z niego, że zmiana terminu zawodów była spowodowana naciskami ze strony Sił Obrony Narodowej oraz że rodzina Kushima wykorzystała posunięcie Sił Obrony Narodowej, aby przetestować działanie broni opracowanej w tajemnicy podczas zawodów biegowych Steeplechase. Tatsuya udaje się do Nary, twierdzy rodziny Kushima, aby dowiedzieć się, jakiego rodzaju eksperymenty przeprowadzają.
