Fabuła kręci się wokół nastoletniego Mahiro Fuwy, którego siostra zginęła w tajemniczych okolicznościach na rok przed przedstawionymi w anime wydarzeniami. Chłopak postanawia odkryć kto stoi za tym morderstwem i podpisuje kontrakt na mocy którego w zamian za pomoc klanowi Kusaribe, jego przedstawicielka – Hakaze Kusaribe pomoże mu odnaleźć morderców jego siostry. W wyniku tego porozumienia bohater zostaje wmieszany w sam środek wydarzeń w owym klanie, które mogą zakończyć się przebudzeniem "Drzewa Exodus" posiadającego moc mogącą zniszczyć cały świat.
