14-letnia Usagi Tsukino spotyka pewnego dnia kotkę, Lunę, która mówi jej, że jest wojowniczką z Księżycowego Królestwa, mającą obronić świat przed złem, a także odnaleźć Księżniczkę i Srebrny Kryształ. Dziewczyna spotyka na swojej drodze cztery pozostałe Czarodziejki, kolejno: Sailor Mercury, Sailor Mars, Sailor Jupiter oraz Sailor Venus. Znajdując się w tarapatach niemal zawsze przychodzi jej z pomocą Tuxedo Kamen. Przez całą serię Czarodziejka z Księżyca walczy z członkami Królestwa Ciemności, którzy także usiłują zdobyć Srebrny Kryształ i zbierają energię od ludzi by wskrzesić swoją królową[3].
Setsuna przychodzi do profesora Tomoe, by odebrać i przygarnąć Hotaru. Usagi i jej przyjaciółki cieszą się z dostania się do liceum. Tymczasem uwięziona w lustrze Nehelenia dowiaduje się, że wszystkie Czarodziejki nadal żyją szczęśliwie.
Haruka, Michiru i Setsuna są zaskoczone, tym jak szybko dorasta przebudzona Hotaru. Dziewczynka przepowiada także "zagładę Białego Księżyca". Jednocześnie Mamoru ma coraz większe kłopoty ze wzrokiem, ponieważ do jego oka dostał się odłamek z lustra Nehelenii.
Drużyna Czarodziejek zauważa, że w szkole dzieją się dziwne rzeczy – większość uczniów obsesyjnie przygląda się swoim odbiciom w lustrze. Ten sam objaw, Usagi widzi u Mamoru, który wkrótce potem zostaje porwany przez Nehelenię.
Po uprowadzeniu Mamoru, stan Chibiusa się pogarsza. Setsuna wyjaśnia, że jest to spowodowane paradoksem czasowym – jeśli Mamoru umrze, to Chibiusa nigdy się nie narodzi. Wojowniczki postanawiają wyruszyć Tuxedo na ratunek.
Wojowniczki zostaje podzielone na pary (Usagi i Makoto, Haruka i Ami, Michiru i Rei, Setsuna i Minako) i są zmuszone do walki z iluzjami Nehelenii. Tymczasem Hotaru i Chibiusa docierają do zamku królowej.
Wszystkie wojowniczki przegrywają swoje walki i zostają uwięzione w lustrach. Gdy Usagi udaje się dotrzeć do zamku, przeprasza ona Nehelenię, za to że niegdyś została zapieczętowana przez Królową Serenity. Dzięki temu klątwa Nehelenii zostaje przełamana.
W Tokio pojawia się najpopularniejszy zespół muzyczny – Trzy Gwiazdy. Z tego powodu, Makoto, Minako i Rei są szczęśliwe. Jedynie Usagi pozostaje niewzruszona, gdyż dowiaduje się, że Mamoru planuje wyjechać, by studiować za granicą. Tymczasem nad Ziemią wisi nowe zagrożenie – Galaxia, która pragnie posiąść ludzki gwiezdne ziarna.
Do szkoły Juuban mają przyjechać uczniowie z wymiany międzyszkolnej. Okazuje się, że są nimi członkowie zespołu Trzy Gwiazdy. W tym samym czasie Żelazna Mysz ma obowiązek po raz kolejny spróbować zdobyć gwiezdne ziarno.
Minako, która marzy o karierze muzycznej, usiłuje za wszelką cenę, umówić się z którymś z członków Trzech Gwiazd. Uniemożliwia jej to Itabashi Saki, fotograf grupy, który zostaje zaatakowany przez Żelazną Mysz.
W szkole Juuban odbywa się egzamin z matematyki, z którym Usagi ma kłopoty. Seiya także nie zalicza testu, ze względu na uciążliwe próby do musicalu, który prowadzi nauczycielka Rei – siostra Angela.
Nauczyciel fizyki z liceum Juuban – pan Amanogawa, przewiduje że odkryta przez niego kometa będzie widoczna przez teleskop. Z tej okazji zaprasza do swojego obserwatorium Taikiego i Ami. Chłopak nie przejawia jednak zbytniego zainteresowania.
Usagi zauważa, że od kilku dni nie towarzyszy jej Luna. Dziewczyny orientują się, że Luna przebywa z Yatenem. Okazuje się, że chłopak potrzebował zwierzątka do występu w programie telewizyjnym.
Usagi i Makoto wybierają się do przyszkolnej szklarni, by zebrać truskawki. Spotykają tam Taikiego, który zaprasza Mako do występu w telewizyjnym programie kulinarnym.
Drużyna czarodziejek usiłuje za wszelką cenę zdobyć bilety na koncert Trzech Gwiazd. Niespodziewanie dowiadują się, że na tym koncercie ma także wystąpić Michiru, która daje im bilety za darmo. Tymczasem Galaxia ostrzega Żelazną Mysz, że jeśli dalej będzie zawodzić, zostanie zastąpiona.
Korzystając z dnia wolnego Seiya postanawia zaprosić Usagi na randkę. Dziewczyna zgadza się pójść z nim, lecz zaprzecza, jakoby miała być to randka. Tymczasem Sailor Iron Mouse dostaje ostatnią szansę wykazania się.
Po śmierci Żelaznej Myszy, jej obowiązki przejmują Aluminiowa Syrena i Ołowiany Kruk. Tymczasem w domu Usagi pojawia się mała dziewczynka – ChibiChibi. Czarodziejki podejrzewają, że być może jest ona siostrą Chibiusy i przybyła z przyszłości. W rozwikłaniu zagadki pomaga im Sailor Pluto.
Usagi, ChibiChibi i przyjaciółki wyjeżdżają na wakacje do domu letniskowego, który należy do kuzyna Rei. W pobliskim kurorcie przebywają także Trzy Gwiazdy, którzy są w trakcie kręcenia zdjęć do serialu. Ośrodek wypoczynkowy zostaje wkrótce zaatakowany.
Rodzina Usagi wyjeżdża, więc dziewczyna musi zostać przez całą dobę sama. Ponieważ w okolicy jej domu miało miejsce sporo włamań, Seiya deklaruje, że zostanie jej ochroniarzem. Postanawia także, że wyjawi jej swoją prawdziwą tożsamość. Wkrótce potem dołączają do niego Yaten, Taiki, a także pozostałe wojowniczki.
Przyjaciółka Ami, Misa jest ciężko chora i leży w szpitalu. Bojąc się nadchodzącej operacji, dziewczynka słucha piosenek Trzech Gwiazd, których jest wielką fanką. Kiedy Usagi dowiaduje się o sytuacji, prosi Taikiego, by odwiedził Misę w szpitalu.
Usagi zauważa, że ChibiChibi ostatnio ciągle znika. Zastanawiając się, dokąd chodzi, postanawia z przyjaciółkami ją śledzić. Okazuje się, że dziewczynka odwiedza bardzo bogatego przedsiębiorcę, który jest także sponsorem Trzech Gwiazd.
Usagi zostaje zapisana do drużyny softballu. Ponieważ nie potrafi w niego grać, Seiya proponuje jej specjalny trening. W tym samym czasie, Sailor Aluminum Siren dostaje ostrzeżenie od Galaxii.
Aluminiowa Syrena przez przypadek odkrywa tożsamość Czarodziejki z Księżyca. Wysyła Usagi specjalne zaproszenie na lot z Trzema Gwiazdami. Na pokładzie statku, zarówno wojowniczki, jak i Sailor Starlights są zmuszone wyjawić swoje prawdziwe twarze.
Po śmierci Aluminiowej Syreny, jej miejsce zajmuje Cynowa Kotka. Tymczasem Usagi i Seiya rozpamiętują ujawnienie swoich tożsamości. Oboje, niezależnie od siebie, udają się po poradę do Rei.
Haruka i Michiru spotykają się z Taikim i Yatenem i kategorycznie zabraniają Seiyi spotykać się z Usagi. Członkowie Trzech Gwiazd chętnie się na to zgadzają. Tymczasem Seiya potajemnie wyjawia Usagi swoją przeszłość.
Drużyna Czarodziejek nadal usiłuje nawiązać współpracę z Trzema Gwiazdami, jednak nie udaje im się to. Ami postanawia wziąć udział w konwencie dla graczy komputerowych, w którym jednym z arbitrów jest Taiki.
Minako otrzymuje zaproszenie na casting muzyczny, w którym zwycięzca otrzyma prawo nagrania płyty. Dziewczyna ma jednak wątpliwości czy powinna tam iść. Jednym z sędziów w tym konkursie jest Yaten.
W liceum Juuban odbywa się festiwal. Na uroczystości zjawia się także Seiya. W tym samym czasie, Taiki i Yaten atakują ChibiChibi, gdyż podejrzewają, że ma ona coś wspólnego z Księżniczką, której poszukują. Sailor Red Crow atakuje natomiast Usagi, ponieważ odkrywa w zapiskach Aluminum Siren, że ma ona prawdziwe gwiezdne ziarno.
Księżniczka planety Pachnących Oliwek, która ukrywała się w imbryczku należącym do ChibiCibi, opowiada drużynie Czarodziejek o swojej przeszłości. Po śmierci Aluminum Siren, Tin Nyanko musi sama wykonywać polecenia Galaxii, lecz cały czas obserwuje Usagi wiedząc, że ma ona prawdziwe gwiezdne ziarno.
Trzy Gwiazdy zapowiadają w mediach rozwiązanie grupy i zakończenie działalności muzycznej. Planują także wystąpić na jednym, pożegnalnym koncercie. W czasie jego trwania, pojawia się Galaxia, która atakuje Ziemię.
Po śmierci Księżniczki planety Pachnących Oliwek, Trzy Gwiazdy, postanawiają ją pomścić i idą szukać Galaxii. Wkrótce potem dołącza do nich drużyna, złożona ze wszystkich dziewięciu czarodziejek. W pierwszej rundzie walki Galaxia zabija Ami, Rei, Makoto i Minako.
Po śmierci przyjaciółek, Usagi jest załamana i nie jest w stanie walczyć. Dodatkowo dowiaduje się, że Galaxia zabija wcześniej Mamoru, odbierając mu gwiezdne ziarno. Zamiast Usagi, do walki przystępują Haruka, Michiru, Setsuna i Hotaru. Dwie pierwsze zgadzają się jednak służyć Galaxii i zabijają swoje dotychczasowe towarzyszki.
Czarodziejka z Księżyca nie może uwierzyć, że Sailor Uranus i Sailor Neptune odwróciły się od niej. Galaxia nakazuje swoim nowym podwładnym, zabicie Usagi, jednak te w ostatniej chwili atakują samą Galaxię. Gdy okazuje się, że nie ma ona gwiezdnego ziarna, Haruka i Michiru umierają.
Trzy Gwiazdy usiłują chronić Czarodziejkę z Księżyca ze wszystkich sił. Tymczasem Galaxia opowiada im, że to ona jest legendarną wojowniczką, która pokonała Chaos i to ona wysłała w kosmos Promyk Nadziei.
ChibiChibi okazuje się być Promykiem Nadziei, którego szukały Trzy Gwiazdy. Usagi, z jego pomocą usiłuje walczyć z Galaxią i pokonuje zło, zapieczętowane wewnątrz niej. Po skończonej walce, gwiezdne ziarna wracają do właścicieli i przywracają życie pozostałym czarodziejkom, Mamoru oraz Księżniczce Kakyuu. Trzy Gwiazdy, wraz z odrodzoną Księżniczką postanawiają powrócić na swoją ojczystą planetę.
