W roku Universal Century 0079, ludzkość żyje w kosmicznych koloniach nazwanych Sides. Side 3, Księstwo Zeonu, wypowiedziało wojnę Federacji Ziemskiej. Po wybuchu wojny upłynęło 8 miesięcy, obie strony są w impasie. Jednak impas zostaje przerwany, kiedy Amuro Ray trafia na Gundama, sekretną broń Federacji Ziemskiej. Teraz Amuro i załoga White Base muszą stawić czoła Zeonowi, aby zakończyć wojnę.
