대재해 후 폐허가 된 세상. 괴이한 요괴가 도사리는 땅에서 생존을 위해 힘겹게 살아가는 사람들. 그중 심부름센터 일을 하는 키루코에게 한 여성이 숨을 거두며 마루를 맡긴다. 이 아이를... 천국으로 데려가 줘.
벽으로 둘러싸인 학원에서 평화로운 나날을 보내는 아이들. 토키오는 시험 중 '밖의 바깥'으로 나가고 싶은지 묻는 이상한 메시지를 받는다. 한편, 황폐해진 세상에서 마루와 키루코는 천국을 향한 여정을 시작한다.
여관에서 기절한 듯 잠이 든 마루와 키루코. 희미한 달빛 아래 괴물의 형상을 발견한다. 그것은 바로 히토쿠이다! 학원에서는 토키오가 바깥 세계에 대해 더욱 의문을 가지고, 시로는 뜻밖의 메시지를 받는다.
그러니까... 난 남자야. 5년 전, 하루키는 존경하는 형 로빈, 그리고 전동 카트 레이서인 누나 키리코와 아사쿠사에서 행복하게 살고 있었다. 그러나 어느 날 레이스 도중 나타난 히토쿠이를 막으려다 참혹한 일을 당하고 만다.
쿠쿠와 함께 기이한 모습의 아기들을 보게 된 토키오. 도대체 무슨 일이 일어나고 있는 것일까? 한편 도쿄로 가는 배에서 물고기 히토쿠이의 공격을 받은 마루와 키루코. 키루코는 이 괴물을 처리할 묘안을 생각해 낸다.
텐트 마을에 도착한 마루와 키루코가 수상한 집단에 대한 정보를 얻는다. 학원에서는 타라오의 병세가 악화되고, 알 수 없는 발자국을 발견한 의사 사와타리가 학생들을 의심한다.
불멸교단을 찾아가던 중, 토토리라는 소녀가 운영하는 호텔에 머물게 된 마루와 키루코. 짐을 맡기고 안전한 식수를 뜨러 가지만 그곳에는 누군가 심한 상처를 입고 쓰러져 있다! 한편 토키오 앞에 예상치 못한 누군가가 모습을 나타낸다.
불멸교단에서 인체 실험이? 마루와 키루코가 리뷰맨의 요청으로 불멸교단 건물에 잠입해 히토쿠이를 처치하기로 한다. 그러나 평소의 냉정함을 잃은 키루코. 여기서 그 의사를 찾을 수 있을까?
부디 한 명만 더 죽여... 우사미 의사를 만난 마루와 키루코. 가림막 뒤 참혹한 모습의 인간을 보고 충격을 받는다. 그사이 리뷰맨이 불멸교단에 쳐들어오고, 키루코는 로빈이 살아있다는 사실을 알게 된다.
우사미의 단추와 키루 광선에 똑같은 마크가 있다니! 마루와 키루코는 마크에 대해 아는 괴상한 남자, 쥬이치를 만난다. 한편, 토키오의 몸 상태에 이상이 생기고 학원에서는 긴급회의가 소집된다.
타카하라 학원의 이바라키 시설에 가기 전, 자신의 아이가 살아 있는지 확인하고 싶어 하는 쥬이치를 돕기 위해 벽의 마을로 향한 마루와 키루코. 도착한 그들에게 기대와 전혀 다른 상황이 펼쳐지는데.
다른 5기생 아이들과 어울리지 않는 오마에게 다가간 미미히메. 이 아이가 검은 안경을 쓰고 다니는 이유는 뭘까? 마루와 키루코는 쥬이치가 준 차를 타고 이바라키 시설로 향한다.
이것이 '아메노누보코'인가? 갑작스러운 공격을 받은 학원. 도망가던 아이들은 벽에 뚫린 구멍을 발견한다. 마루와 키루코는 부흥성이 관리하는 번화한 마을에 도착한다.
선생님이 말한 시험의 답을 찾기 위해 벽에 뚫린 구멍을 통해 밖의 바깥으로 나간 미미히메, 시로, 안즈 그리고 타카. 끔찍한 일을 당한 키루코는 하염없이 눈물을 흘린다.
