En 2030, au Japon, un virus transforme les humains en monstres dont l'apparence change selon leur âge, leur genre et leurs origines. Cette maladie est appelée “gibia", une référence au gibier qu'ils sont devenus. Venus tout droit de l'époque d'Edo, un samouraï et un ninja luttent contre ce fléau, accompagnés d'une femme médecin qui tente de trouver un remède contre le gibia. Ils doivent faire face aux attaques incessantes de ces créatures, mais aussi se méfier des hors-la-loi qui s'en prennent aux voyageurs...
Le monde a subi un fléau sans précédent. Une mystérieuse maladie contagieuse transforme les gens en monstres. Par ailleurs, en pleine ère Keishô, Sensui et Kenroku sont exilés. Mais suite à une tempête, ils finissent par s’échouer… dans le temps.
Sensui et Kenroku doivent rapidement s’acclimater à cette nouvelle époque et ce monde chaotique. Kathleen sera bien évidemment là pour les guider et utiliser leur force contre les gibias, toujours plus nombreux et agressifs.
L’attaque des gibias de la veille a détruit quasiment tout le campement. Les survivants vont devoir s’exiler ailleurs. Mais avant le grand départ, le professeur Yoshinaga doit récupérer les échantillons pour le vaccin.
Adam passe récupérer le professeur pour rejoindre le reste du groupe. Toutefois, le temps se gâte et les nuages viennent assombrir la zone. Une météo idéale pour les gibias, qui s’empressent d’attaquer Sensui et ses camarades.
L’étau se resserre, l’effectif s’amenuise. Encerclés par les gibas, nos camarades doivent de nouveau sortir les armes pour s’en sortir. Adam, toujours secoué par la perte de Brian, compte en découdre coûte que coûte.
Piégés dans le tunnel, tous se battent pour en sortir sains et saufs. Kathleen est isolée et vite attaquée par les gibias. Ayame, une inconnue, arrive à sa rescousse. La jeune ex-policière s’intègre rapidement au groupe.
Après avoir sauvé Kathleen, Ayame rejoint le groupe. Pendant ce temps, les malfrats qui les ont attaqués plus tôt comptent bien prendre leur revanche et partent à la poursuite du véhicule de nos héros.
Exténué par ses combats, Sensui a besoin de repos. Malheureusement, Yurika, la mère de Kathleen, s’est fait piquer par un gibia. Pour ne pas faire souffrir les siens avant sa possible transformation, celle-ci décide de partir.
Kenroku et Ayame retrouvent le corps sans vie de Yukinojô. Kathleen est inconsolable. Pendant ce temps, le groupe de malfrats est obligé de faire une halte pour réparer leur véhicule en rade…
Le groupe arrive au centre de recherche, mais celui-ci est envahi par les gibias. Les malfrats qui les pourchassaient se sentent maintenant redevables et décident de s’allier à nos héros. Le professeur, lui, peaufine son vaccin.
Alors que Yoshinaga est sur le point de finaliser son vaccin, le groupe est dérangé par le meteora qui les suivait jusqu’ici. Tous se mettent donc contre lui pour le vaincre une bonne fois pour toutes.
Après avoir dévoilé son plan, Yoshinaga montre son vrai visage. Transformé en gibia, il n’aura aucune pitié pour ceux qui étaient ses camarades il y a peu encore. Sensui et Kenroku défendront Kathleen coûte que coûte.