Keichi Morisato est un jeune étudiant du campus de Nekomi Kodai, sa vie n'est qu'une succession de malheurs. En effet, il ne plaît à aucune fille à cause de sa petite taille ; il vit dans une chambre d'étudiant où ses sempai le considèrent comme leur bonne et enfin il a toujours du mal à boucler ses fins de mois. Mais malgré tous ces aléas de la vie, Keichi reste quelqu'un de pur et sincère, il ne se plaint jamais de son sort et aide avec plaisir ceux qui ont besoin de lui et se contente de son seul plaisir : les motos. Son destin était donc ainsi décidé : il devra vivre sous sa mauvaise étoile tout au long de sa vie. Mais les Dieux en ont décidé autrement ; en effet, ils lui feront un jour joindre par téléphone une Déesse du bonheur qui lui permettra de réaliser un vœu. Et cette Déesse s'appelle Belldandy !
Après une misérable journée pendant laquelle les ennuis l'ont poursuivi, Keiichi, un jeune étudiant malchanceux mais optimiste et plein de bonne volonté reçoit la visite d'une jeune femme qui se présente comme une déesse venue exaucer un de ses vœux...
Keiichi, qui a demandé à ce que Belldandy reste vivre avec lui jusqu'à la fin de ses jours, est mis à la porte de la résidence pour étudiants dans laquelle il vivait. Accompagné de la déesse, il tente de trouver un nouveau logement où tous deux soient acceptés...
Keiichi et Belldandy se rendent dans un temple bouddhiste. Le moine qui le dirige accepte de les loger sous son toit à condition que tous deux se chargent d'entretenir le bâtiment dans lequel il vit...
Keiichi fait visiter à Belldany le campus de son université. Elle y attire tous les regards à la plus grande exaspération de Sayoko, une jeune femme qui était jusque là le centre d'intérêt de tous les étudiants...
Keiichi prend conscience des sentiments amoureux qu'il éprouve envers Belldandy et commence à ressentir du remords pour avoir forcé la déesse à rester vivre à ses côtés...
Megumi, la sœur de Keiichi, a été acceptée dans la même université que son frère. Après quelques recherches elle se trouve un logement, mais celui-ci semble être hanté par un esprit...
Belldandy demande à Sayoko de lui expliquer la signification de la Saint Valentin. Cette dernière la renvoie vers Toshiyuki, le play-boy du campus, qui emmène la déesse à l'hôtel...
En cherchant un remède pour soigner une Belldandy malade, Keiichi fait la connaissance d'une jolie infirmière, Urd, qui est en réalité une autre déesse et une sœur de Belldandy...
Sayoko et Toshiyuki commencent à suspecter la véritable identité de Belldandy. Pour en avoir le coeur net, ils enlèvent Keiichi...
Afin de reprendre Belldandy des mains de Keiichi, Toshiyuki défie le club de mécanique dans une course. Si Keiichi perd, le club de mécanique sera dissous et Belldandy devra rejoindre celui du play-boy...
Le scellé qui emprisonnait le démon Mara est rompu. Décidée à se venger des déesses qui l'avaient emprisonnée, elle infiltre le temple bouddhiste et métamorphose Keiichi en faisant en sorte que ni Urd ni Belldandy ne puissent le retransformer...
Afin de pousser Belldandy à quitter la Terre, Mara ensorcelle Keiichi pour qu'il soit attiré par Sayoko en lieu et place de la déesse...
Skuld, la jeune sœur de Belldandy se rend sur Terre suite aux dysfonctionnements de Yggdrasyl, l'ordinateur central divin qui veille au bon fonctionnement de l'univers, dysfonctionnements causées par la présence de Belldandy sur Terre...
Afin de distraire Skuld et de l'aider à s'intégrer, Belldandy organise un concours de robots entre sa jeune sœur et Megumi...
Afin d'attirer l'attention de sa grande sœur, Skuld construit un robot qu'elle baptise Banpei-Kun, chargé de maintenir Keiichi loin de Belldandy...
Mara fait appel à Senbei, le dieu du malheur et de la pauvreté pour séparer Belldandy de Keiichi et la renvoyer dans les cieux...
Belldandy convainc Sora, une jeune étudiante timide et manquant de confiance en elle, de participer à une compétition de kart...
Megumi organise un séjour pour amoureux afin d'aider son frère à déclarer sa flamme à Belldandy. Le couple est suivi à leurs dépens par Urd et Skuld qui ont bien l'intention d'intervenir d'une manière ou d'une autre dans la déclaration...
Urd prépare filtre d'amour pour aider Keiichi à se déclarer. Mais la potion, sabotée entre temps par Skuld qui refuse toujours que sa sœur soit éprise du jeune homme, est bue par Belldandy...
Urd et Skuld doivent retourner aux cieux pour régler les problèmes de Yggdrasil. Pour éviter que Keiichi profite de leur absence, Skuld transforme Keiichi en femme. En essayant de préparer un antidote, Belldandy contracte un virus et tombe gravement malade...
Skuld, qui admire profondément Belldandy, cherche à obtenir son propre ange. Ses efforts font remonter des souvenirs difficiles pour Urd...
Mara libère le Lord de la Terreur. Ce dernier prend possession du corps de Urd plaçant Belldandy devant un choix difficile : sceller sa sœur ou la laisser détruire la Terre pour la transformer en un monde aux mains des démons...
Pour sauver sa sœur, Belldandy fait appel à la flute Midgard, le seul remède qui permette de stopper le programme de destruction de la Terre...
Défait mais pas complètement vaincu, le Lord de la Terreur prend possession du corps de Keiichi replaçant Belldandy devant un autre choix difficile. Pour régler définitivement le problème, les cieux envoient l'une de leur Walkyries...
