En raison de sa santé précaire, Kôichi Sasakibara est contraint de quitter la capitale pour la province de Yomiyama. Intégrant la troisième 3, il est loin de se douter que sa rencontre avec Mei Misaki, une mystérieuse jeune fille ignorée par ses camarades, marque dès lors l’avènement d’une série de catastrophes macabres révélant l’existence d’une ancienne malédiction…
Kouichi débarque dans sa nouvelle école et y trouve une atmosphère étrange. Ses camarades sont attentionnés mais sa classe est souvent à l'écart. De plus, il a rencontré une fille qu'aucun des autres élèves ne semble connaître.
La relation entre Kouichi et Meiji semble à sens unique. Il saisit chaque opportunité de lui parler, mais elle ne semble pas comprendre ce qu'il dit. Ses réponses semblent de plus en plus incompréhensibles au fil des jours, et les élèves de la classe sont de plus en plus soupçonneux.
Une pièce remplie de marionnettes est l'endroit choisi par Mei pour raconter à Kouichi l'histoire de la mort mystérieuse de trois étudiants 26 ans plus tôt. Glaner plus d'informations auprès des élèves s'avère difficile, mais sa tante Reiko peut lui en apprendre plus.
La rumeur de la "malédiction de la classe 3" prend de l'ampleur avec le décès accidentel d'un élève. Koiuchi se désespérant d'en savoir plus, se tourne vers Mei qui refuse de lui en dire plus. Izumi Akazawa, la directrice de sécurité, commence son enquête sur la Classe 3.
La tension monte dans la classe 3 à la suite de l'étrange accident de Mizuno. Izumi est nommée responsable de classe à l'insu de Kouichi. Les rumeurs se répandent, mais personne ne veut parler.
La classe 3 invoque un sort contre les 26 ans écoulés pour empêcher de nouvelles calamités. Kouichi commence à accepter ce qui se passe. Mais il trouve cela insensé et commence à passer plus de temps avec Mei.
Du sang a été de nouveau répandu et la Classe 3 réalise que la malédiction continue. Le rituel d'exorcisme est annulé. Tout le monde est sur les dents et se demande qui est réellement mort. Pendant ce temps, Kouichi découvre un événement vieux de 15 ans.
Kouichi, Reiko et Matsunaga de rendent en villégiature. Alors qu'ils sont au soleil sur la plage, ils rencontrent Mei qui réside à proximité.
Un accident à l'extérieur de Yomiyama met une fois de plus la classe 3 sur les dents. Se fiant aux vagues chuchotements de Matsunaga, Kouichi décide d'enquêter sur l'ancienne salle de la Classe 3 dans le bâtiment original de l'école.
Le nombre de victimes continue de croître et Kouichi finit par trouver la cassette enregistrée par Matsunaga. Ils écoutent la cassette pendant le voyage de classe et cherchent de que Matsunaga a fait pour briser la malédiction.
La cassette de Matsunaga a révélé ses secrets et le moyen de rompre le maléfice. Pendant que Kouichi et ses amis essaient d'viter de nouveaux désastres, la cassette disparît soudainement.
Le chaos règne dans la résidence pendant que les élèves cherchent à arrêter définitivement la malédiction de la classe 3. Kouichi parvindra-t-il à trouver la solution avant qu'il n'y ait une nouvelle victime?