Megaton Musashi

Der Schüler Yamato aus Akagicho wird nach einer Prügelei eingesperrt. Dann taucht sein Klassenkamerad Teru dort auf und schlägt ihm einen Deal vor. Als Gegenleistung dafür, dass er ihn aus dem Gefängnis holt, soll Yamato einen Job für ihn annehmen. Yamato und sein Rivale Ryugo machen sich auf den Weg zum vereinbarten Ort, werden aber von Terus Schlägern angegriffen. Als die beiden Teenager die Schlägerei gewinnen, bringt Teru sie in den Untergrund, wo den Jungen der Schock ihres Lebens in die Glieder fährt.

Yamato, Teru und Ryugo steigen in Musashi und verlassen die Zuflucht. Draußen erwartet sie ein erbitterter Kampf gegen die Aliens. Yamato und sein Team stürzen sich ins Getümmel und erringen dank Musashis Fähigkeiten einige Siege. Doch die Aliens verwandeln ihre Kampfmaschinen und drehen den Spieß um.

Arshem ergreift von Asunas Körper Besitz und setzt Yamato nach, um ihn zu töten. Der Versuch scheitert jedoch, da er sie bemerkt. Um ihre Tarnung aufrechtzuerhalten, behauptet sie, dass sie in ihn verliebt sei. Später erfahren Yamato und seine Teamkameraden, dass einer der Piloten ermordet wurde.

Der Austauschschüler Reiji wirkt auf seine Mitschüler unheimlich, weil er seine ganze Zeit mit Katzen zu verbringen scheint. Als er eines Tages eine Katze verfolgt, stolpert er in die Oblivion Bay. Wie von einer geheimnisvollen Macht gelenkt, klettert er in das Cockpit des neuen Rogue. Mit der Katze an Bord aktiviert er den Autopiloten und fliegt aufs Schlachtfeld.

In der Stadt treffen Yamato und seine Freunde auf eine Straßengang aus Ryugos Vergangenheit. Als sie der Bande in ihr geheimes Versteck folgen, sind sie überrascht, wer sich als der Boss der Bande herausstellt. Es kommt zu einer heftigen Schlägerei, die aber durch Reijis Auftauchen unterbrochen wird. Yamato und seine Freunde erhalten den Befehl, sich in der Basis zu melden. Sie ziehen an der Seite von Reiji in die Schlacht und kämpfen zum ersten Mal gemeinsam. Doch, was sie erwartet ...

Bei einem Treffen der Befehlshabenden erklärt Sayaka den Plan, Ixia an die Oberfläche zu bringen und das legendäre Sanctuary anzusteuern. Aber um das Ziel zu erreichen, ist ein ausgeklügeltes Betriebssystem nötig. Schließlich werden sie von Takumi und Kota entdeckt, die sich nach Oblivion Bay geschlichen haben, um sich die neuen Rogues anzusehen.

Von ihrer Alien-Besessenheit befreit, erzählt Asuna Yamato und seinen Freunden alles, was sie weiß. Sie machen sich auf die Suche nach dem Hotel, das den Aliens als Versteck dient. Währenddessen ist Kota total durchnässt, nachdem er einen Welpen vor dem Ertrinken gerettet hat. Momoka kann ihn nicht einfach so zurücklassen und nimmt ihn mit zu sich nach Hause. Während Kota ihr seine Lebensgeschichte erzählt, taucht plötzlich ein Agent auf und versperrt ihnen den Weg.

Yamato und seine Freunde schaffen es, Sarzant in die Enge zu treiben, der von Soji Besitz ergriffen hatte, doch Sarzant entkommt in letzter Sekunde. Kiyoka wird Zeugin der Konfrontation. Yamato lügt sie an und behauptet, dass Soji seinen Rat wegen eines Stalkers wollte. Und dann sind da noch Jun und Momoka, die als Piloten zu Partnern werden. Wenn sie um die Vorherrschaft wetteifern, werden die Funken fliegen!

Yamato und seine Freunde kämpfen gegen unbekannte, gepanzerte Aliens in ihren Maschinen. Umgeben von einem elektromagnetischen Zaun wird Musashi immer wieder angegriffen. Die Angriffe führen dazu, dass Ryugo sich an seine echte Mutter erinnert. Als es um alles oder nichts geht, lernt Yamato von einer unerwarteten Person, wie man mit dem Dark Hunter fertigwerden kann.

In Oblivion Bay laufen die Vorbereitungen für den Start von Ixia von der Oberfläche auf Hochtouren. Inmitten all dieser Aktivitäten erinnert sich Teru an den Tag der Zerstörung. Nachdem er seine Eltern verloren hatte, wurde er von einem Alien gerettet. Yamato trifft sich mit Arshem, um zu erfahren, warum die Aliens die Erde angegriffen haben und wie sie darüber denkt.

Alle Rogues werden mobilisiert, um einen Angriff einer Horde von Draktor abzuwehren. Yamato und Arshem ziehen ebenfalls mit Musashi in die Schlacht. Die Piloten kämpfen erbittert gegen die Außerirdischen, um Ixia mehr Zeit für den Startplan zu verschaffen. Dann taucht Bürgermeister Takekuma in Landeye auf ...

Während der Schock über die verblüffenden Enthüllungen ganz Landeye und das Schlachtfeld erschüttert, erhält Teru eine Nachricht von Sayaka und fasst neuen Mut. Der Feind durchbricht ihr Verteidigungsnetz an der Frontlinie, und Ginta befiehlt Jun und Momoka, aus Maximus zu fliehen. Aber Jun ignoriert ihn und stellt sich dem Feind entgegen, um ihn und alle anderen zu schützen.

Ein ganzer Tag ist seit der Schlacht vergangen. Die Gebäudereparaturen in Akagicho sind abgeschlossen und die Erinnerungen der Menschen wurden wiederhergestellt. In Oblivion Bay wurde eine neue Organisationsstruktur eingerichtet. Grieffas, der eingekerkert wurde, nachdem er sich den Befehlen von Königin Crouzade widersetzt hatte, bricht mit seinen vertrauten Kameraden aus dem Gefängnis aus.

Um herauszufinden, wo das Mutterschiff der Draktor im Kampf gegen die Ixia abgestürzt ist, besucht Arshem die Canyon-Stadt Solon. Zur gleichen Zeit verbreiten sich in der Seikoku-Akademie Gerüchte darüber, wer die Schule kontrolliert. Yamato, Jun und Reiji untersuchen die wahre Identität der verdächtigen Person, an die sie keine Erinnerungen haben.

In den Ruinen der Zuflucht tauchen Maschinen der Aliens auf, die Feuerbälle abfeuern. Yamato und Co. werden dem Angriff in arge Bedrängnis gebracht. Arshem, die mit Victor zusammenarbeitet, freundet sich mit den unbeugsamen Terranern an, die sich weigern ihr Leben aufzugeben, selbst wenn das Rote Ockerfieber sie packt. Einmal mehr spürt sie das Gewicht der Missetaten, die ihr Volk begangen hat.

Während sich die Ixia auf ihren zweiten Sprung vorbereitet, infiltriert Masamune Landeye für seine eigenen Pläne. Teru und Reiji sind die ersten, die von diesen Plänen erfahren und sofort aggressive Maßnahmen gegen ihn einleiten. Währenddessen erzählt Jun Momoka von den Veränderungen in ihrem Körper.

Yugra und Miysis schleichen sich mit dem Auftrag, mehr über Yamato in Erfahrung zu bringen, an Bord der Ixia. Zur gleichen Zeit diskutieren die Blaumäntel darüber, wie sie die Draktor-Festung an der Volt-Linie einnehmen können. Kota und der Rest der Mitarbeiter von Landeye stellen eine Strategie vor, die der Schlüssel zu ihrem Sieg sein wird.

Angesichts der bevorstehenden Festungskampagne bereiten sich alle Piloten und Besatzungsmitglieder der Ixia auf ihre eigene Art und Weise vor. Währenddessen erfahren Yugra und Miysis von Mirais Existenz. Teru spürt die Gefahr und holt Mirai aus dem Labor, aber ...

Die Ixia kommt an ihrem Ziel an und alle werden ins Innere geführt, wo sie eine riesige Basis vorfinden, die mit der gesammelten Technologie der Erde gebaut wurde. Kommandant Dixenberg bittet Margaret, ihm an einen anderen Ort zu folgen.

Dixenberg fliegt mit Margaret ins All, um sein Ziel zu erreichen. Die Mitarbeiter von Landeye, die von Professor Haruma und seinem Assistenten auf die Brücke des Schiffes gerufen wurden, starten das Schlachtschiff, um sie zu verfolgen.