Mediet Yoh Asakura deltager i en kampturnering, der afholdes med 500 års mellemrum, hvor han dyster mod andre shamaner i et forsøg på at blive den almægtige Shaman King.
Shamanen Yoh Asakura tilbyder at hjælpe sin nye klassekammerat Manta med at konfrontere en berygtet bølle ved hjælp af en legendarisk samurai-ånd.
Yoh og Manta møder shamanen Ren, der er nådesløs i en kamp mod en rod. Yoh bliver rasende over Rens misbrug af sine kræfter og går op imod ham i en kamp.
Anna fortæller Yoh om den nye turnering for at krone den næste Shaman King. Rens søster, Jun, udfordrer Yoh til en kamp, hvor Amidamaru vil være præmien.
Efter at have besat Ryu tager Tokageroh Manta som gidsel. Yoh og Amidamaru kæmper imod ham, men Tokageroh bruger Harusame, hvilket gør kampen ulige.
En af Patch Officiants, Silva, slipper sine fem dyreånder løs mod Yoh for at finde ud af, om han fortjener at deltage i shamankampen.
Yoh er nu kvalificeret til turneringen og går i kamp mod sin første modstander, Horohoro fra Hokkaido, der er en stolt Ainu-shaman, som kan manipulere is og sne.
Faust VIII, en åndemaner, der kan manipulere lig, gør Yoh rasende, da han udfører sadistiske eksperimenter på Manta inden deres kamp.
Med Ren som sin næste modstander tager Yoh afstand fra Manta for at sørge for sin vens sikkerhed. Senere vender Yoh tilbage til Izumo for at fortsætte sin træning.
Den sidste kamp i den indledende runde begynder. De skæbnestyrede rivaler Yoh og Ren kæmper til det yderste, men hvem fortjener at komme med i hovedturneringen?
Ren vender tilbage til Kina for at tage sig af et uafsluttet mellemværende. BōZ-munkene overrumpler Yoh og Tamao, men et velkendt ansigt kommer dem til undsætning.
Den fængslede Ren sværger, at han vil besejre sin far, efter han taber til ham i en kamp. I mellemtiden tager Yoh og de andre til Kina for at redde Ren.
Ren og hans allierede baner sig vej mod En. Tao-familiens overhoved er godt nok en formidabel fjende, men Yoh og de andre er ikke bange af sig.
Yohs gruppe møder den selvudråbte fremtidige konge. Hovedturneringens deltagere går ombord på et fly, uvidende om, at deres første prøvelse skal til at begynde.
Mens Yoh og de andre forbereder sig på at rejse til en by, hvor Patchlandsbyen en gang lå, dukker Ønskekvisteren Lyserg op og beder om at blive en del af deres gruppe.
Yohmei beder Anna overlevere en gammel bog, der tilhører Asakura-familien, til Yoh i USA. Horohoros vagt Kororo forsvinder.
Yoh og vennerne søger efter svar og ankommer til den gamle Patchlandsby, hvor de bliver mødt af Haos håndlangere.
Ryu møder Boris og slipper en ny kraft fri, som han har opnået i sin træning med Yohs bedstefar Yohmei. En uventet person viser sig for Manta og Anna.
Yohs gruppe når frem til Patchlandsbyen, hvor de finder De Mægtige Ånder og hører om formålet med shamankampen. En munter shaman slår sig sammen med gruppen.
Mens Yoh og vennerne leder efter Lyserg, bliver de konfronteret af Faust, som kommer med et overraskende tilbud. Omsider er scenen sat, og shamankampen kan begynde.
Ren-holdet kæmper mod Haos lakajer, Team Tsuchi-gumi. Joco tænker på sin fortid med en vis person efter at være blevet trængt op i en krog i en desperat situation.
Den anden shamankamp begynder, og Team X-I fra X-Laws kæmper mod Egyptens Team Niles. Men X-I's nyeste medlem er en, Yohs gruppe kender alt for godt.
Team Funbari Hot Springs kæmper deres første kamp mod Icemen. Men Yoh sværger at slå dem med ét angreb takket være Ultra Senji Ryakketsu.
Icemen bliver overvældet af Fausts nye oversjæl og vakler under presset – men sender et iskoldt modangreb, da kampen nærmer sig sin slutning.
Yoh mødes med Lyserg til en længe ventet samtale, men andre lurer i nærheden og griber ind. Til sidst kæmper X-Laws' Team X-III mod Haos Team Hoshi-gumi.
Yoh ser hjælpeløs til, da Team X-III kæmper desperat mod Hao, som afslører sin fødselshemmelighed og sin tusindårige historie med Asakura-klanen.
Yohs venner er rystede over afsløringen om Hao. Senere dukker en mystisk maskeret mand op hos Ren-holdet med et tilbud om at gøre dem stærkere.
Efter at have været i kamp mod sin magtfulde modstander får Ren ny styrke. Shamankampen fortsætter, og Haos følgere begynder at angribe hold uden for ringen.
Horohoro og Joco forsøger at undslippe Haos tilhænger, Peyote Díaz, sammen med den sårede Ren, men Yoh gør en overraskende entré. Andetsteds skrider Anna til handling.
Mens Anna hjælper Mikihisas holdkammerater med at flygte til deres shamankamp, intensiveres Tamao og Juns kamp mod Haos følgere.
Yoh accepterer Jeannes betingelser som betaling for at helbrede Ren, hvilket chokerer deres venner. Anna mindes den første gang, hun mødte Yoh for fem år siden.
Yoh prøver at forstå sin forlovede, som fortsat afviser ham, og hendes forbindelse til dæmonen, der angriber byen. Matamunes fortid bliver afsløret.
Lidt efter lidt kommer Anna og Yoh tættere på hinanden, da de sammen besøger templet i anledning af nytåret, men Annas kræfter skaber en farlig situation.
Yoh og Matamune ankommer på bjerget Osore for at redde Anna fra den store dæmon, der udspringer af menneskers hjerter, men Yoh har kun én chance for at redde hende.
Yohs har ikke længere nogen chance for at blive shamankonge. Ryu og Manta udspionerer Jeanne, der genopliver Ren, hvilket har en uventet stærk bivirkning.
Horohoro afslutter kampen mod Brockens hold. Lyserg bringer den sårede Horohoro til Yohs hold, da Peyote angriber med intentioner om at dræbe.
Mikihisas holdkammerater, de to søskende Ludsev og Seyram, søger hævn over den person, der dræbte deres far. Men Yoh træder til, inden det er for sent.
Golems nye bruger går amok, mens Ren, Ludsev og de andre lægger en plan for at tale dem til fornuft. Hao giver Opacho en opgave.
Opacho giver Yoh en besked: Yoh skal vende tilbage til shamankampen, ellers vil Hao ødelægge Golem og børnene. Hvad bliver hans beslutning?
Yohs kamp med X-love om at vende tilbage til shamankampen slutter, da Luchist Lasso og Jeanne indtager scenen. Senere afslører Yoh en plan om at slå Hao.
Shamankampene går ind i den afgørende fase, og hold Ren skal op imod en modstander, der kan ophæve en persons oversjæl.
Horohoro sikrer hold Ren sejren, hvilket betyder at deres næste modstander bliver hold Funbari. En skummel gruppe kontakter Yoh og andre.
Yoh fortsætter med at kæmpe sig gennem helvede med sin nye evne. Shamankampen bliver mere kompliceret, og en hidtil uset prøvelse venter Yohs hold.
Marco og de andre forsøger desperat at modstå Haos angreb og beskytte Jeanne. Der opstår en uventet krise på grund af Haos konflikt med X-love.
Haos lakajer begynder at tvivle på hans intentioner. Anna konfronterer Hao, som afslører sin ultimative oversjæl. Yohs gruppe træder ind i ringen.
Shamankampen mellem Funbari og Ren går i gang! Men før Yoh kan nå at sætte et modangreb ind, tager kampen en uventet drejning.
Yoh og de andre træder ind på området, hvor den anden turnering skal foregå, men før den når at gå i gang, kommer Yoh med en overraskende meddelelse.
Vinderen af Shamankampen vil endeligt blive afsløret. Yoh og de andre forsøger at forhindre Hao i at slutte sig til Den store ånd.
Yoh og de andre giver alt, hvad de har, men på trods af deres store anstrengelser og ofre, lykkedes det Hao at nå kongens skrin.
Yoh og de andre ankommer til Kalims bolig, hvor de beslutter sig for at holde et velfortjent hvil. Men der dukker en overraskelse op.
Under slaget mod Kalim kommer det mørke, der har plaget Horohoro, endelig op til overfladen.
Gruppen når omsider frem til det sidste anlæg, hvor de møder Rutherford, den farligste modstander, de endnu har stået overfor.
Hao slipper sine mægtige nye kræfter løs imod Yoh og de andre, men gruppen nægter at opgive håbet.